随着研究的深入，他们逐渐揭开了这个神秘文明背后的秘密。原来，在白垩纪末期，一场时间叛乱正在悄然酝酿。当时的文明发现了时间的漏洞，试图利用时间的力量改变宇宙的规则，摆脱星际联盟的统治。然而，他们的计划被星际联盟察觉，最终以失败告终。这些文明被囚禁在时间囚笼中，他们的记忆基因被封存在地球生物体内，成为了地球生命进化的一部分。

陈哲宇决心拯救他的祖父和那些被囚禁的文明。他和林修远、周念真开始寻找解开时间囚笼的方法。他们在古老的典籍中寻找线索，在神秘的遗迹中破解谜题，与时间赛跑，与未知的危险对抗。

在一次探索中，他们发现了一个隐藏在星球深处的密室。密室中摆放着一个巨大的时间装置，上面刻满了复杂的符号和图案。经过一番研究，他们发现这个装置正是解开时间囚笼的关键。然而，启动这个装置需要巨大的能量，而他们目前所拥有的能量远远不够。

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就在他们陷入困境时，陈哲宇突然想到了一个办法。他利用祖父在《璇玑要术》中留下的线索，找到了一种可以吸收宇宙能量的方法。他们在星球表面建立了一座能量收集站，通过特殊的装置将宇宙中的能量转化为启动时间装置所需的能量。

经过漫长的等待，能量终于收集完毕。林修远按下了启动按钮，时间装置开始运转起来。一道道光芒从装置中射出，连接到各个时间囚笼上。囚笼上的禁锢力量逐渐减弱，里面的文明开始感受到了自由的希望。

然而，他们的行动引起了星际联盟的注意。一支星际舰队迅速向他们所在的星球驶来，试图阻止他们解开时间囚笼。林修远、陈哲宇和周念真没有退缩，他们决定与星际联盟展开一场殊死搏斗。

在激烈的战斗中，林修远凭借着他的机械义肢和出色的战斗技巧，与星际联盟的士兵展开了近身搏斗。陈哲宇则利用时间装置的力量，制造出时间漩涡，干扰星际舰队的进攻。周念真则运用她对时间规则的理解，为他们提供支援和掩护。

战斗进入了白热化阶段，双方都付出了惨重的代价。但林修远他们没有放弃，他们心中只有一个信念：拯救那些被囚禁的文明，打破时间的枷锁。

最终，在他们的努力下，时间囚笼的禁锢力量被彻底打破。那些被囚禁的文明纷纷从囚笼中挣脱出来，他们重获自由，向着宇宙的深处飞去。陈哲宇也终于找到了他的祖父，祖孙二人相拥而泣。

星际联盟见大势已去，只好撤退。林修远他们成功地完成了任务，成为了宇宙中的英雄。但他们知道，这只是时间长河中的一个小插曲，宇宙中还有无数的奥秘等待着他们去探索，还有更多的挑战等待着他们去面对。

在返回地球的途中，林修远看着窗外的宇宙星空，心中充满了感慨。他的机械义肢在战斗中受到了损坏，但他却感到无比的自豪。因为他用自己的力量，改变了一些人的命运，让那些被囚禁的文明重获自由。

而陈哲宇和周念真，也在这次冒险中，对时间和生命有了更深的理解。他们知道，时间是一种神秘而强大的力量，它既可以囚禁文明，也可以孕育希望。而他们，将继续在时间的长河中前行，探索更多关于宇宙和生命的奥秘。